在云中的Cryo-em

在这次采访中，Azom TalKs到Michael Cianfrocco，博士，密歇根大学的研究助理教授，关于在云中举行的Cryo-Em图像。

电子显微镜的背景是什么？你在工作中使用了多久了？

自2007年以来，我一直在做Cryo-Em（Cryo-Croto-Electronic显微镜）当我开始作为伯克利伊娃诺戈斯的研究生。我开始使用T12精神和TECNAI F20 S / TEM与电影，但最终刻向CCD（电荷耦合器件）探测器，然后刚刚向前移动。

所以，在研究生院后，它只是用电子显微镜继续感觉到？

是的，在毕业生学校我主要只是做了很多Cryo-EM网格冻结和成像分析。最后我觉得我需要选择一个生物系统来专注于，但我也想继续做Cryo-em。这就是为什么我最终与萨马拉Reck-Peterson和Andres Leschziner一起在UC San Diego进行联合，因为我可以继续使用电子显微镜。

当我第一次撞到Cryo-Em的计算瓶颈时，真的很棒。计算访问是漂亮的变量，因为我们在不同的计算集群之间传播，所有这些都有自己的排队时间。我们只是不想在那种情况下。那是我们意识到云计算所拥有的潜力，而且从那时起，我就会成为云家人。

您可以为您的集团目前的研究提供电梯音高吗？

本质上，我们研究的是细胞内部的运动方式。我们想要了解我们的运动蛋白如何知道何时开始、停止和维持细胞骨架运输(即微管)。

你在Cryo-em的未来看到了什么？我们需要发生什么让我们到达那里？

正如我在Cryo-em的研讨会上，我意识到新用户最大的障碍是第一个步骤;他们需要知道他们的蛋白是否在网格上表现得正常，实际情况在微图中是一种粒子，如果CTF（对比度传递函数）是好的等等，那么所有这些东西都可以将所有这些东西真正压缩成一步。

我的工厂里有人说;我有蛋白质和纳米蛋白，我如何知道蛋白质是否在我的纳米乐中？由于他们是新的来Cryo-em，他们只是摆弄了一切，并获得了一两周或两个人的答案。它会带他们这么长时间，它应该只是他们在几个小时内得到的东西。

所以，现在，现在，我们最需要的是捕获像我这样的人的头部所有的专业知识，他们一直在做一段时间，并将其转换为深入学习的算法。本质上是关于数据和显微镜的用户选择的集合;哪些显微照片好或坏，哪些粒子，哪个课程平均值等。我们只需要将其达到新用户的黑匣子;欧洲杯猜球平台然后，正如他们所学习的那样，他们可以通过增加的专业知识开始更换更多这些参数。

来自我跑步的这些介绍研讨会，这种增加的可访问性绝对是对我们前进最关键的事情。

我们在哪里可以了解更多有关您的研讨会的更多信息，以及一般的Cryo-em云计算？

对于那些想要了解有关Cryoem的云计算工具的人员，我们最近在Solutional Biology Chinoce上发布了一篇论文，在软件平台上直接向亚马逊Web服务提交了Cryo-Em工作。（读：cryoem-cloud-tools：用于在云中部署和管理Cryo-Em作业的软件平台此外，读者可以了解更多关于云计算的云计算的研讨会，我们在U-M网站上托管了Michigan大学。（读：在密歇根大学的研讨会上，科学家们获得了使用低温电磁数据工具的实际经验）

更多细节，一般来说，可以找到我们的小组网站。

关于Michael Cianfrocco，Ph.D

Michael Cianfrocco，Ph.D.是一个研究助理教授在密歇根生命科学学院大学以及助理教授生物化学，密歇根大学医学院的大学部。欧洲杯线上买球我们在2019年美国晶体协会年度会议上与他坐下来讨论他的背景与EM以及他希望在该技术的未来看到的内容。