利用旋转圆盘显微镜进行空间分辨转录组学实验

空间转录组学(也称为多路复用)是一种能够在2D或3D生物环境中发现大量(Xn) rna的细胞生物学技术。 多路复用在肿瘤生物学、神经科学、疾病靶点诊断、发育和行为研究等领域是一种流行的方法。欧洲杯线上买球

已经开发了许多技术来使空间解决转录组-也称为多路或空间基因组学。这些技术包括FISSEQ、osmFISH、instaSEQ、MERFISH、STARmap和seqFISH。

空间转录组学提供了许多好处,包括为多个基因产物提供空间和序列信息的能力。直到最近,还只能在单个细胞水平上对rna进行批量测序,在此过程中,任何组织环境信息(生物背景)都将丢失。

深入了解基因表达的位置及其周围环境(微环境),有可能揭示大脑功能、发育、癌症和神经退行性疾病的分子基础。

多路杂交实验通常涉及多轮杂交和检测。每一轮都在同一个样本中顺序执行。

染色(Xn)分子需要去除探针和样品再次杂交。在蜻蜓旋转盘共焦系统上附加一个微流控系统可以实现这一点。

机械上,荧光探针将标记杂交RNA分子。在探头被冲走之前,通常通过扫描体积蒙太奇来获取图像数据。在获取每个图像数据集之后,使用“条带和洗涤”步骤,然后是进一步的杂交轮。

这个过程将重复N次,导致大量的编码图像数据。下面的信息图总结了使用多路成像采集所需的顺序步骤蜻蜓共焦 。 

利用旋转圆盘显微镜进行空间分辨转录组学实验

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