维也纳大学化学学院的丹尼斯·库尔兹巴赫(Dennis Kurzbach)包括一小群研究人员,刚刚发表在“自然方案”中的一种先进的NMR(核磁共振)方法中,以监测快速而复杂的生物分子事件,例如蛋白质折叠。
例如,长期以来,蛋白质折叠被认为是现代研究的最大奥秘之一。在氨基酸链中采用3D结构和功能的关键过程发生在毫秒内。作为这种快速的,蛋白质折叠事件通常无法通过NMR光谱法来表征。研究分子结构的标准方法。利用超极化水,研究人员现在已经开发了一种大大增强蛋白质,核酸和其他生物分子的信号的方法。这使得可能监测诸如蛋白质折叠之类的过程。
启用实时NMR
使用NMR光谱法,研究人员可以测量原子的磁性,从而分析溶液中分子的原子结构。丹尼斯·库兹巴赫(Dennis Kurzbach)和他的同事克里斯蒂安·希尔蒂(Christian Hilty)和卢西奥·弗雷德曼(Lucio Frydman)(以色列)的方法基于NMR,并可以实时监测生物过程。通过使用超极化水,研究人员显着增强了研究样品的NMR信号,因此提高了该方法的敏感性。
使用超极化方法,更精确的溶解DNP(D-DNP),可以增强信号超过10,000倍。“超极化水充当测量过程中蛋白质NMR信号的助推器。超极化水的氢核与蛋白质的氢核交换,从而将信号强度转移到后者中,”化学学院NMR中心副负责人的丹尼斯·库尔兹巴赫(Dennis Kurzbach)说。
使用新方法,研究人员可以每100毫秒记录NMR光谱,并使用它来跟踪单个氨基酸的3-D坐标以及它们如何随时间变化。“这使我们能够监视以毫秒为单位的过程并区分各个原子,”化学家丹尼斯·库兹巴赫(Dennis Kurzbach)说,他专注于开发新方法的研究。
NMR用于蛋白质分析的使用增加
在他们的研究中,作者详细描述了他们的技术,从超极化到超极化水到NMR光谱仪的转移,再到超极化水与样品溶液的混合以及NMR测量。
此外,它们提供了六个用于应用方法的示例,包括观察蛋白质折叠,甚至RNA(核酸)和RNA结合蛋白的相互作用,作为细胞中基因表达的基础。根据科学家的说法,新方法可用于对RNA,DNA和多肽的特定研究,尤其是当信号增强达到1,000倍的“魔术”数字时。
配备超极化原型的NMR光谱仪是由超极化水提升的NMR的先决条件。但是,这种基础设施尚不常见。自2020年以来,维也纳大学化学学院就配备了DDNP-NMR设备,该设备由Dennis Kurzbach建造,基于ERC起始赠款。
资源:https://www.univie.ac.at/en/